En la FaHCE existen más de 15 carreras organizadas en 11 departamentos. Cada departamento es presidido por un director que asesora al Consejo Directivo y ejecuta sus disposiciones. Los directores, a su vez, son asesorados por las Juntas Consultivas Departamentales, conformadas por 3 docentes, 2 estudiantes y 1 graduado. Las Juntas tratan cuestiones de política académica como la selección de la planta docente de cada carrera, la aplicación del plan de estudios, la creación de nuevas materias, etc. Su carácter consultivo implica que las decisiones sean o puedan ser tomadas en última instancia sólo por el director. Siendo así, las opiniones del resto de los representantes de los claustros no constituyen voto con peso autónomo real, porque dependen de la buena voluntad y los lineamientos políticos de cada director.
INTERCOMISIONES es un espacio conformado por las comisiones de estudiantes de historia, filosofía, sociología, ciencias de la educación, geografía, lenguas modernas, bibliotecología, ciencias exactas y naturales, educación física y letras, abierto desde un comienzo a la participación de todos y todas las estudiantes de las carreras de Humanidades, aunque no participen en una comisión.
